V případě dotací Čapího hnízdo se Andreji Babišovi začíná chvět půda pod nohama. Kvůli podezření z dotačního podvodu, v němž se jedná o padesát milionů korun, částku pro něj spíše směšnou, může přijít o svůj precizně budovaný obrázek čestného velkopodnikatele, který přišel do politiky proto, že měl už dost paktování tradičních stran s kmotry.

Čapí hnízdo je pro Babiše dle jeho vlastní slov srdeční záležitost. Ve filmu Víta Klusáka Matrix AB o něm řekl: „Myslím, že je to nejlepší projekt, co jsem kdy vymyslel. Napadlo mě to, když jsem s dětmi čekal ve frontě v pražské zoo na krmení koz. Byla tam obrovská fronta a já nesnáším čekání. Tak jsem si řekl, že udělám podobný projekt... Nevede sem dálnice, takže se teď kolegy z vlády snažím přesvědčit především o investici do infrastruktury.“

Čapí hnízdo je luxusní resort, jehož vybudování stálo dle informací z dotační žádosti k Regionálnímu operačnímu programu Střední Čechy půl miliardy a pětadvacet milionů korun, z čehož zhruba padesát milionů byla právě dotace z evropských fondů.

Klíčová otázka celé kauzy zní: kdo vlastně od dotačního úřadu onen padesátimilionový příspěvek dostal. Babišův Agrofert to formálně vzato být nesměl. Dotační program byl určen takzvaným malým a středním firmám, což chemicko-potravinářský koncern vlastnící fabriky hned v několika evropských zemích rozhodně není. Proto bylo potřeba věci navlíknout trochu jinak…

Původní vlastník zchátralého zemědělského areálu ZZN Agro Pelhřimov ze stáje Agrofertu se — jak se můžeme domnívat, právě kvůli zálusku na evropskou dotaci — stal koncem roku 2007 společností s anonymními akciemi. A získal nový název Farma Čapí hnízdo.