Podle zdroje Deníku Referendum určují současné směřování ministerstva především náměstci, které si ministr Josef Dobeš s sebou do úřadu přivedl z ABL. „Když agendě ministerstva dostatečně nerozumí ministr, není to nic neobvyklého. Většinou si s sebou ovšem přivede schopné náměstky, kteří problematice rozumějí,“ vysvětluje princip fungování ministerstva zdroj.

Dobeš si ovšem přivedl jako náměstka bývalého místopředsedu představenstva bezpečnostní firmy ABL Kryštofa Hajna, jehož jedinou kvalifikací je dvouleté působení v akademickém senátu ČVUT v dobách jeho studií. O fungování ministerstva však nemá nejmenší povědomí. „Například z počátku vůbec netušil, že pod ministerstvo školství spadá také výzkum,“ popisuje Hajnovy znalosti zdroj z ministerstva.

Vzhledem k faktu, že náměstkyně Bartoňová měla silnou politickou pozici díky ODS stejně jako další náměstek Jan Kocourek, jenž je bratrem ministra průmyslu a obchodu Martina Koucourka, musel Hajnovi uvolnit místo Vlastimil Růžička, jenž byl sice respektovaným odborníkem, neměl ale potřebnou politickou záštitu.

Druhou šedou eminencí ministerstva je bývalý personalista ABL Šimon Mastný, který působí jako vrchní ředitel kabinetu ministra. Právě Hajn a jeho kolega jsou přes všechnu neznalost skutečnými vládci ministerstva. „Projde jen to, co Hajn schválí, cokoli se mu nelíbí, Dobeš automaticky odmítá. V podstatě to tu řídí ABL. Jejich chování je navíc nesmírně arogantní, jak vůči řadovým zaměstnancům, tak vůči ředitelům sekcí,“ popisuje zdroj.