Zadáním Akreditační komise MŠMT je pečovat o kvalitu vysokoškolského vzdělávání a všestranně posuzovat vědeckou a vzdělávací činnost na českých vysokých školách. Jako vrcholná autorita v této významné oblasti je a měla by být Akreditační komise samozřejmě zcela nezávislá.

Avšak autoři z Národohospodářské fakulty konstatují, že o nezávislosti nemůže být v rozhodování komise řeč a obviňují ji, že o žádostech rozhoduje pouze formálně. To dokládají kvantitativní analýzou, ze které plyne, že na jedno rozhodnutí má komise v průměru tři minuty. Jinými slovy řečeno: text děkana Národohospodářské fakulty VŠE v Praze Jiřího Schwarze a jeho kolegů nařkl Akreditační komisi z netransparentního a formálního rozhodování o licencích.